首先此工程未辦理竣工圖和竣工驗收報告，不符合結(jié)算條件，應在辦理竣工圖和竣工驗收報告后再明確結(jié)算的方式，根據(jù)雙方簽訂承包合同規(guī)定的結(jié)算方式進行結(jié)算。

　　本工程招標時按照清單報價的方式招標，并且甲乙雙方合同約定按照清單單價進行結(jié)算，合同約定具有法律效力，那么在工程結(jié)算時就應該遵守雙方合同的約定，咨詢公司作為中介機構(gòu)是無權(quán)改變工程的結(jié)算計價方式的。

　　材料和作法變更無簽字不能作為工程結(jié)算的依據(jù)，應該以事實為依據(jù)：如隱蔽工程驗收記錄、分部分項工程質(zhì)量檢驗批、影像資料、雙方的工作聯(lián)系單、會議紀要等資料文件。如果乙方又不能提供這些事實依據(jù)，甲方有權(quán)拒結(jié)相應項目的變更費用。工程在施工過程中出現(xiàn)變更時，甲乙雙方應該及時辦理相應手續(xù)，避免工程以后給結(jié)算時帶來的扯皮。

　　在工程施工過程中出現(xiàn)變更，合同中應該有約定出現(xiàn)變更時變更部分工程價款的調(diào)整方式和辦法：如采用定額計價方式、參考近似的清單單價、雙方現(xiàn)場綜合單價簽證等。再是工程量清單報價中有一張表格《分部分項工程量清單綜合單價分析表》，在出現(xiàn)變更時，可以參照這個表格看一下清單綜合單價的組成，相應的增減變更的分項工程子目，重新組價，組成工程變更后新的清單單價，但管理費率和利潤率不能修改。